Service de Séquençage Nouvelle Génération

La plateforme génomique de l'IRIC offre un service de séquençage Nouvelle Génération de haute qualité pouvant générer avec précision plusieurs centaines de gigabases. À cet effet, La plateforme utilise la technologie de pointe Illumina. Sélectionnez un instrument pour voir les applications disponibles.

Illumina NextSeq 500

Illumina NextSeq 500

Voici les différentes options sur le NextSeq:

Spécifications pour 1 lame

Nom du kit IlluminaNb de pb séquencéesNb de reads (fragments)
NextSeq 75 cycles High Output v275400 M
NextSeq 150 cycles High Output v2150400 M
NextSeq 150 cycles Mid Output v2150130 M
NextSeq 300 cycles Mid Output v2300130 M

Tous les kits NextSeq peuvent être utilisés pour du séquençage "paired-end".

Exemple:

Si vous utilisez le NextSeq 150 cycles High Output v2 pour un séquençage paired-end, vous obtiendrez 400M de reads de 75pb d'une extrémité (Read1), et 400M de reads de 75pb de l'autre extrémité (Read2) de vos fragments.

Applications :

  • RNASeq
  • Transcriptome
  • Amplicons
  • Petits ARNs (miRNAs)
  • Exome
  • Régions génomiques ciblées
  • ChIP (immunoprécipitation de la chromatine)
  • Séquençage de l'ADN génomique (Génome complet)

Illumina MiSeq

Illumina MiSeq

Voici les différentes options sur le MiSeq:

Nom du kit IlluminaNb de pb séquencéesNb de reads maximum
MiSeq 300 cycles Nano v23001 M
MiSeq 500 cycles Nano v25001 M reads
MiSeq 300 cycles Micro v23004 M reads
MiSeq Reagent Kit v2 (50-cycle)5015 M reads
MiSeq Reagent Kit v3 (150-cycle)15025 M reads
MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycle)30015 M reads
MiSeq Reagent Kit v2 (500-cycle)50015 M reads
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)60025 M reads

Tous les kits MiSeq peuvent être utilises en paired end.
Le nombre de reads correspond au nombre de single-read ou au nombre de paired-end assemblées.

Séquençage d’amplicons

Si vous séquencez une librairie d’amplicons, nous ne pouvons pas garantir le maximum de reads si c’est la première fois que vous séquencez votre librairie avec nous. De plus, nous devrons peut-être ajouter du PhiX afin d’augmenter la diversité de la librairie.

Pour le séquençage d’amplicons, nous utilisons les indexes Nextera. SVP, nous contactez avant de faire votre amplification.

Applications :

  • RNASeq
  • Transcriptome
  • Amplicons
  • Petits ARNs (miRNAs)
  • Exome
  • Régions génomiques ciblées
  • ChIP (immunoprécipitation de la chromatine)
  • Séquençage de l'ADN génomique (Génome complet)

Documentation :

Pour plus d'informations et pour vous guider dans vos projets de séquençage, veuillez contacter:
Jennifer Huber

Pour toute question concernant les analyses bio-informatique, contactez:
Patrick Gendron